音乐治疗成为正式学门始于第二次世界大战期间及稍后,也就是在音乐开始被注意到能够促进复原及治疗“战壕休克”病人之际。之后不多久,为了提升音乐治疗的科学性及提供学者们有关的准则与支持,美国的国家音乐治疗协会 (National Association for Music Therapy)成立于1950年,美国音乐治疗协会(American Association for Music Therapy)则创始于1971年。由于音乐疗法之应用广泛,过去四十年来其在不同临床领域的应用一直受到重视。从文献上可以看出,音乐疗法于现代精神医学之应用,早于1950及1960年代便被重视;自1980年代起,则更推广到其他身体医疗上之应用。